تولید انواع داروهای نوترکیب، واکسن‌های جدید، روش‌های نوین تشخیص مولکولی بیماری‌ها و عوامل بیماری‌زا، تولید انواع آنزیم‌ها و محصولات صنعتی به روش‌های زیست‌فناوری برخی از کاربردهای گسترده و مفید این دانش است. یکی از عرصه‌های مهم کاربرد زیست‌فناوری و مهندسی ژنتیک استفاده ازآن‌جهت اصلاح بذر و تولید محصولات نوین کشاورزی با ویژگی‌های خاص مانند افزایش تولید، مقاومت به آفات، خشکی، شوری و عوامل دیگر است. به این نوع محصولات دستکاری‌شده ژنتیکی تراریخته نیز گفته می‌شود.

طی جلسه¬ ای با حضور رییس و معاونان پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران و محققان، اعضای هیات علمی، کارشناسان و کارکنان بخش تحقیقات کشت بافت و انتقال ژن پژوهشکده، بخش انتقال ژن از بخش کشت بافت و سلول و بخش ایمنی زیستی از بخش تحقیقات بیوتکنولوژی میکروبی تفکیک و تحت عنوان بخش جدید «مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی» آغاز به کار کرد.